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成果 - 動的ネットワーク抽出のためのイン・シリコパイプラインの構成

Cell Illustrator Online for GNP. Macrophage Genomic Expression Database. このサイトは 文部科学省 ゲノムネットワークプロジェクト (GNP). 内の 研究課題: 動的ネットワーク抽出のためのイン シリコパイプラインの構成. 研究期間: 平成 19 年度 20 年度. マクロファージの分化 活性化ネットワークに関する遺伝子発現情報等の大規模 総合的データから動的転写制御ネットワークを抽出し、利用するための計算戦略をイン シリコパイプラインとして構築する。 このパイプラインを使って、マクロファージの分化 活性化に関して、分化のマスター遺伝子やクリティカルパスウェイのイン シリコ探索及びシミュレーションによる分化 活性化の再現解析が可能となる。 約 1000 万エントリーからなるヒトマクロファージデータベース及びそのための API ライブラリを開発した。 環境で利用できるように JAVA コード化を完了し CSML Pipeline. 参考資料: 平成 21 年 1 月 19 日 GNP公開シンポジウムポスター. Fujita A, S...

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