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October 3, 2014. NcRNAblog は、新学術非コードRNAの終了に伴い、今後は下記のブログに引き継がれます。その名も、新学術ncRNAネオタクソノミ公式ブログ. 12304;私の最初の研究テーマ】の連載を皮切りに、この業界の最新動向、過去の動向、秘密の情報、どんどん発信していきます。 皆さん長らくご愛読(?)ありがとうございました。 August 30, 2014. 複合体が可溶化出来れば精製なんてオチャノコサイサイと思っていたのが大間違いで、結果として、単に我々の腕が悪かっただけなのでしょうが、MS2、PP7などのタグをつけて複合体を引っ張ってくるというアプローチはうまくいきませんでした。うまくいかないというのは要するに、関係のないRNAで引っ張ってきたコントロールとほとんど銀染のパターンが変わらない、ということです。 ということで、SDGの分画をPLLコートしたスライドグラスにのせて、そのままin situ hybridization! ともあれ、アシベ探しは振り出しに戻ってしまったわけですが、(1)でちょっと触れた通り&#...12288;というわけで、Celf3...

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October 3, 2014. NcRNAblog は、新学術非コードRNAの終了に伴い、今後は下記のブログに引き継がれます。その名も、新学術ncRNAネオタクソノミ公式ブログ. 12304;私の最初の研究テーマ】の連載を皮切りに、この業界の最新動向、過去の動向、秘密の情報、どんどん発信していきます。 皆さん長らくご愛読(?)ありがとうございました。 August 30, 2014. 複合体が可溶化出来れば精製なんてオチャノコサイサイと思っていたのが大間違いで、結果として、単に我々の腕が悪かっただけなのでしょうが、MS2、PP7などのタグをつけて複合体を引っ張ってくるというアプローチはうまくいきませんでした。うまくいかないというのは要するに、関係のないRNAで引っ張ってきたコントロールとほとんど銀染のパターンが変わらない、ということです。 ということで、SDGの分画をPLLコートしたスライドグラスにのせて、そのままin situ hybridization! ともあれ、アシベ探しは振り出しに戻ってしまったわけですが、(1)でちょっと触れた通り&#...12288;というわけで、Celf3...
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1 ncrna blog
2 ブログ移転
3 ncrnablog neo
4 アシベ探しの続きは新しいネオブログにて
5 no comments
6 アシベを求めて(3)
7 ーncrnaが非特異的にタンパク質に結合してしまうので、特異性が出ない
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9 まずはアシベ探しのそもそもから
10 長鎖ノンコーディングrnaの複合体は溶けん!!
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ncrna blog,ブログ移転,ncrnablog neo,アシベ探しの続きは新しいネオブログにて,no comments,アシベを求めて(3),ーncrnaが非特異的にタンパク質に結合してしまうので、特異性が出ない,アシベを求めて(2),まずはアシベ探しのそもそもから,長鎖ノンコーディングrnaの複合体は溶けん!!,アシベを求めて(1),を書きました,話を簡単にまとめますと、,8595;新規ncrnaであるgomafuの相互作用タンパク質を取りたかった,weeks,data,readcsv,ここで、
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October 3, 2014. NcRNAblog は、新学術非コードRNAの終了に伴い、今後は下記のブログに引き継がれます。その名も、新学術ncRNAネオタクソノミ公式ブログ. 12304;私の最初の研究テーマ】の連載を皮切りに、この業界の最新動向、過去の動向、秘密の情報、どんどん発信していきます。 皆さん長らくご愛読(?)ありがとうございました。 August 30, 2014. 複合体が可溶化出来れば精製なんてオチャノコサイサイと思っていたのが大間違いで、結果として、単に我々の腕が悪かっただけなのでしょうが、MS2、PP7などのタグをつけて複合体を引っ張ってくるというアプローチはうまくいきませんでした。うまくいかないというのは要するに、関係のないRNAで引っ張ってきたコントロールとほとんど銀染のパターンが変わらない、ということです。 ということで、SDGの分画をPLLコートしたスライドグラスにのせて、そのままin situ hybridization! ともあれ、アシベ探しは振り出しに戻ってしまったわけですが、(1)でちょっと触れた通り&#...12288;というわけで、Celf3...

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ncRNA+Blog: March 2014

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March 28, 2014. 長かったようで短かった5年間も終わろうとしています。この領域が立ち上がるか否か、最終ヒアリングに泊さんと影山さんが臨まれたのは、羽生ー郷田の名人戦第7局、フルセットの末に郷田さんが惜しくも破れた2009年6月末の頃のことでした。ちょうどそのときエピジェネティックスに関する内藤シンポジウムが札幌であり、たまたま佐渡さんと一緒だったのですが、「俺たちもうやる事ないもんね。祈るしかないよね。」ということで、まさに祈るような気持ちで、でも懇親会の飲み物はしっかりいただきながら、成り行きを見守っていたのを良く覚えています。 手前の話で言いますと、「Gomafuの結合タンパク質を見つけたらアシベと名付ければ」、という影山さんの素晴らしいアドバイスを実現すべく、今で言うところのCHARTやCHIRPの技術開発を試みていたのですが、なかなかうまくいかず、アプローチを変えて同定されてきたのが既に確固たる地位を固めていたブランチ部位結合タンパク質であるSF1。。&#1...これも手前味噌で失礼しますが、影山班の分担であった僕の課題、核内構造体を形成する長鎖ncRN...この5年間で技術的に一...

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ncRNA+Blog: June 2014

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June 28, 2014. 満々の領域名。領域名を考える時に、実体が伴っているのだから名前負けしてはいけない!と意気込み過ぎて、領域代表廣瀬さんのオリジナルの「タクソノミ」に、よからぬ連中の遊び心で「ネオ」が付加されてちょっと浮いてしまっている感はありますが、よろしくお願いします。非コードRNAの継続領域という位置づけではありませんが、バトンをしっかりと受け止めて、さらに加速していきたい。ボルトの後半のように加速していきたい。いや、前半からロケットスタートをしたい。ただしドーピングは厳禁!! 80年代なのか現代なのか微妙にネタがブラックにかぶっておりますが、このノンコーディングRNAネオタクソノミという概念、今後、ノンコーディングRNA研究において非常に重要な概念になると思っています。ネオタクソノミ?なんじゃそれ?という方も多いと思われますが、夢のコラボ、ネオタクソノミ領域代表の北大の 廣瀬さん、おなじみ泊さん、三嶋さんによる総説. ジンクピリチオンの効能書きですが、手短かに言えば、タンパク質の研究をするときに日常的に行っているアミノ酸配列から予測される機能ドメインに基づい...

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ncRNA+Blog: Rで行こう!!〜その1

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July 12, 2014. Rで行こう!!〜その1. 新学術「ノンコーディングRNAネオタクソノミ」領域は発足したものの、班員の間での情報共有、情報発信のやり方はまだ決まっていません。ですので、こちらのほうで、しばらく覚え書きを続けさせていただきます。まずは、「Rで行こう!!〜その1」ということで。 そもそも何故唐突にRかということなのですが、現在Journal of Cell Biologyなどで推奨されている図でエクセルのグラフ機能に無い図をかなり簡単に作れるから、という事に尽きます。ちなみに僕自身は統計についての知識はサッパリですし、Rも、使いこなしている人がイチローなら、少年野球の補欠ぐらいのレベルです。そもそもエクセルで作った図ですら、自分の論文にのせたのは学生の頃は皆無。ポスドクで留学した時の論文がはじめて。しかも、「写真見たら分かるじゃないですか。統計データ集める意味わかりません。&#12301...でも、それで良いのかな?Rならこんな図が簡単に書けます。 Subscribe to: Post Comments (Atom). 3 Outreach in Science.

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ncRNA+Blog: July 2014

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July 26, 2014. Rで行こう!!〜その2. Rを使うのにはアプリケーションをインストールしなくてはいけません。一番手軽で親しみやすいのは、エクセルやワードと同じように、単体のアプリケーションをインストールする事で、東大の農学研究科の 門田さんのホームページ. Http:/ www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/ kadota/r seq.html#install. Http:/ www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/ kadota/R install mac.pdf. ちなみに、このホームページはすごい充実ぶり。今度授業にモグリにいこうかな、、、. さて、ここでエア実験。次のようなウエスタンの定量の結果がでてきたとしましょう。 WTのタンパク質量:5.3, 2.9, 3.4, 5.2, 4.6. KOのタンパク質量:9.2, 7.4, 3.5, 6.9, 8.2. で、やる事は簡単。Rコンソール画面で次の文字を打ち込むだけ。このままコピペでコンソール画面に貼付けてリターンを押しても構いません。 Boxplot (data, add=TRUE, ylim=c(0,max(dat...

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ncRNA+Blog: August 2013

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August 30, 2013. 暑い暑いと言う元気もないぐらい汗だらだら、油断しているとすぐに首筋からぷーんと異臭が漂う寝間着の処置に困っていたのが懐かしいぐらい、ここ埼玉ではひんやりとした朝の空気の中出勤するような季節になってしまいました。と思いきや、また盛夏さながらの熱帯夜もどきがきたり。日本の夏、なめるべからず。でも、一晩過ごすたびに、少しずつ秋の訪れを実感するこの季節がやってきました。 RNA学会が夏の季語なら、RNAフロンティアミーティングは秋の季語です。以前こちらでも紹介したかもしれませんが、フロンティアミーティングという名称は、何を隠そう、何も隠さず、それまでは「若手の会」という名前だったのです。ところが、諸事情で科研費からのサポートが全く頂けない事態に陥り、その時に企業の方からよりご賛助を頂きやすい名称にしなければという思惑もあり、また、「若手の会」だと、ただ単に酒...ん、そんな面白そうなミーティングがあるのか。どれどれ、参加してみようか、と思われている方がおられましたら、締め切りはとっくに過ぎていますが&#122...August 23, 2013. などという、これ...

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Functional Machinery for non-coding RNAs. 第5回 最終年度 領域会議が2014年1月8日 10日 2泊3日 の日程で. RNAフロンティアミーティング2013 が 9月3日 5日に 静岡県伊豆市 ラフォーレ修善寺にて. 第5回 最終年度 領域会議が2014年1月8日 10日 2泊3日 の日程で. 2013年9月23日 25日にカナダケベック州にて開催される RiboClub 2013. 2013年9月23日 25日にカナダケベック州にて開催される RiboClub 2013. 問合先 Mail: webadmin [at mark] ncrna.jp. 領域代表: 泊 幸秀 113-0032 東京都文京区弥生1-1-1 TEL: 03-5841-7839 FAX: 03-5841-8485. 事務局: 影山 裕二 657-8501 神戸市灘区六甲台町1-1 神戸大学自然科学系先端融合研究環 遺伝子実験センター TEL: 078-803-5950 FAX: 078-803-5951.

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Non-coding RNAs for personalised pain medicine · ncRNAPain

Non-coding RNAs for personalised pain medicine. NcRNAPain: on the trail of chronic pain. This project has received funding from the European Union’s Seventh Framework Programme for research, technological development and demonstration under grant agreement No 602133.

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Tropomyosin isoforms differentially affect muscle contractility in the head and body regions in the nematode Caenorhabditis elegans. Paraspeckles: Where Long Noncoding RNA Meets Phase Separation. Live imaging of X chromosome inactivation and reactivation dynamics. Real-space and real-time dynamics of CRISPR-Cas9 visualized by high-speed atomic force microscopy. Defects in dosage compensation impact global gene regulation in the mouse trophoblast. EMBO meeting @ Weismann Institute (3).

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Gffread除了可以提取FA序列,还有一个附属功能是GFF与GTF间的转换 gffread In.gff3 -T -o Out.gtf gffread In.gtf -o Out.gff3 Try! How to Calculate Upper Quartile. 8260; 共 91字 ⁄ 暂无评论. 8260; 阅读 112 views 次. Gffread除了可以提取FA序列,还有一个附属功能是GFF与GTF间的转换 gffread In.gff3 -T -o Out.gtf gffread In.gtf -o Out.gff3 Try! 8260; 阅读 347 views 次. The percent of cases that are at or below a score. But only count half of the cases that are at the score. Example: i. RNA methylation recently found to b. Agilent Microarray Annotation and E. 8260; 评论数 1.

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Bioinformatics Tools and Databases for Functional RNA Analysis. NcRNAorg is the portal site for bioinformatics tools and databases spcialized for functional RNAs. The developments in this cite were partially supported by “The Functional RNA Project” funded by New Energy and Industrial Technology Development Organization (NEDO). Results of various analysis on RNA secondary structures in one page! Accurate prediction of RNA secondary structure. Functional RNA Database (archived at NBDC).

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October 3, 2014. NcRNAblog は、新学術非コードRNAの終了に伴い、今後は下記のブログに引き継がれます。その名も、新学術ncRNAネオタクソノミ公式ブログ. 12304;私の最初の研究テーマ】の連載を皮切りに、この業界の最新動向、過去の動向、秘密の情報、どんどん発信していきます。 皆さん長らくご愛読(?)ありがとうございました。 August 30, 2014. 複合体が可溶化出来れば精製なんてオチャノコサイサイと思っていたのが大間違いで、結果として、単に我々の腕が悪かっただけなのでしょうが、MS2、PP7などのタグをつけて複合体を引っ張ってくるというアプローチはうまくいきませんでした。うまくいかないというのは要するに、関係のないRNAで引っ張ってきたコントロールとほとんど銀染のパターンが変わらない、ということです。 ということで、SDGの分画をPLLコートしたスライドグラスにのせて、そのままin situ hybridization! ともあれ、アシベ探しは振り出しに戻ってしまったわけですが、(1)でちょっと触れた通り&#...12288;というわけで、Celf3...

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The miRNA body-map

9,829,564 datapoints. Dissecting miRNA function through integrative genomics. The microRNA body map is a repository of RT-qPCR miRNA expression data and functional miRNA annotation in normal and diseased human tissues. The accompanying expression analysis pipeline. Tool, predicted miRNA functions for your miRNA of choice can be retrieved. The function2miRNA. Additional figures and examples of data analysis are listed under the tutorial section. Additional datasets can be uploaded. P Mestdagh et al., ...

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